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Ein weiterer Sieg für Foldit Gamers zeigt die Macht der Crowdsourcing

2012-02-02 6
   
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Ein weiterer Sieg für Foldit Gamers zeigt die Macht der Crowdsourcing

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Spieler des Online - Faltung Spiel Protein Foldit haben einen weiteren Meilenstein erreicht, einen 18-fach, mehr aktive Version eines Modells Enzym zu schaffen. Die Spieler arbeiteten an einem Enzym, das die Diels-Alder - Reaktion katalysiert, die bei der Synthese von verschiedenen chemischen Produkten verwendet wird ( laut Wikipedia ist die "Mona Lisa" von Reaktionen in der organischen Chemie betrachtet).

Im Jahr 2010 entworfen Wissenschaftler eine funktionelle Diels-Alderase rechen von Grund auf neu, aber mit einer Bindungstasche für das Paar von Reaktanden, die zu offen und zu geringe Aktivität war. Weil sie es nicht in der Lage waren , weiter zu verbessern , forderte sie die Foldit Spieler mit besseren Designs zu entwickeln . Durch zwei verschiedene Puzzles, eine von vier Aminosäure umzubauen auf das Enzym Schleifen Kontakt mit den Reaktanden zu erhöhen, und eine andere, die neue Schleife zu stabilisieren, die Spieler auf der Suche nach der besten Wertung ihren Weg durch getüftelt (niedrigster Energie ) -Konfigurationen. Von den fast 200.000 resultierenden Entwürfe synthetisierten die Forscher dann eine Reihe von Test-Enzyme und schließlich die letzte, 18-fach, mehr aktives Enzym.

Zwar gibt es keine unmittelbaren Anwendungen für die jeweilige Diels-Alder-Reaktion, die das Enzym katalysiert und seine Aktivität ist immer noch relativ gering ist, zeigt es deutlich die Macht dieser Art von Forschung Crowdsourcing. Die Wissenschaftler suchen nun in kleine Protein-Inhibitoren zu verbessern, die an und blockieren binden, um die Pandemie von 1918 Influenza-Virus. "Jetzt Foldit Spieler arbeiten mehr potente Inhibitoren zu machen" , sagte Baker. "Das sind spannend, weil diese Medikamente sein könnte."

Die Arbeit an der Diels-Alderase wurde diese Woche in Nature Biotechnology veröffentlicht.



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